Ο κ. Νικόλαος Ε. Καραπιδάκης γεννήθηκε στο Ηράκλειο Κρήτης.
Είναι πτυχιούχος κλασικής φιλολογίας του Πανεπιστημίου του Στρασβούργου (1973-1977), αρχειονόμος-παλαιογράφος, απόφοιτος της École Nationale des Chartes (1978-1982) και Διδάκτωρ Ιστορίας Πανεπιστήμιο της Σορβόνης Ι (1988).
Ο κ. Καραπιδάκης είναι τ. Πρόεδρος της Εφορείας των Γενικών Αρχείων του Κράτους από το Νοέμβριο 2010 έως σήμερα. Από το 2000, είναι καθηγητής Α΄ βαθμίδας στο Ιόνιο Πανεπιστήμιο, στο γνωστικό αντικείμενο «Ιστορία της Μεσαιωνικής Δύσης και της μεταφοράς δυτικών θεσμών στην Ανατολική Μεσόγειο».
Από τον Αύγουστο 2012, είναι Διευθυντής του περιοδικού Νέα Εστία και από το 2004, Διευθυντής της σειράς «Ιστορία και Πολιτική» και της «Μικρής σειράς Ιστορίας» στις εκδόσεις της Εστίας. Ο κ. Καραπιδάκης είναι Μέλος της Επιστημονικής Επιτροπής του επιστημονικού περιοδικού Τα Ιστορικά.
Πρόσφατες δημοσιεύσεις:
- «Διαβάζοντας και ξαναδιαβάζοντας τον Σπύρο Ασδραχά», Σπύρος Ασδραχάς, Ίδρυμα της Βουλής των Ελλήνων για τον Κοινοβουλευτισμό και τη Δημοκρατία, Αθήνα, 2019, 13-30.
- «Η ίδρυση, η οργάνωση και η λειτουργία των ιστορικών αρχείων της Επτανήσου. Ένας αναστοχασμός», Πρακτικά ΙΑ΄Πανιονίου Συνεδρίου, Αργοστόλι, 2019, 83-94
- «Μια περίπτωση ομοφυλοφιλίας σ’ ένα βενετικό σκάφος τον 18ο αιώνα», Πρακτικά ΙΑ΄Πανιονίου Συνεδρίου, Αργοστόλι, 2019, 509-518.
- «Διοικητικοί τρόποι αφήγησης της Ιστορίας», Τα Ιστορικά, 70 Οκτώβριος 2019, 3-32.
Τιμητικές διακρίσεις:
- Officier dans l’ordre des palmes académiques (Ιούλιος 2015)
- Ακαδημία Αθηνών, βραβείο Ελένης και Πάνου Ψημένου (Δεκέμβριος 2015)
- Chevalier dans l’ordre des Arts et des Lettres (Μάιος 2016)